24 декабря 1990 года в Костомукшу от церкви «Святой Троицы» приехала миссионерская группа «Свет миру» (12 человек) из г. Нововолынска, Украина. Приглашена была она епископом Василием Бутовым. Руководителем группы был Цвор Павел Ананьевич, он также был первым пастором церкви.
Днём рождения Церкви считается 21 июля 1991 года, когда состоялось первое водное крещение по вере. Его приняли — 26 человек. Первые богослужения в то время проводились в 21 аудитории ДК «Дружба». Затем богослужения стали проводиться в 26 аудитории, которая вмещала больше людей. Кода и здесь стало тесно, служения стали проводить в актовом зале общежития по проспекту Горняков, д. 2 «Г».
На встрече с работниками Дворца культуры в 1991 году было принято решение открыть Воскресную школу, которую постоянно посещали около 500 детей. Для обучения и подготовки учителей Воскресной школы периодически проводились и проводятся специальные семинары. Каждое праздничное служение на Рождество и Пасху готовилась театральная постановка с участием детей.
В 1995 году в Костомукше проходила Карельская конференция, на которой были рукоположены пасторы и дьяконы Церкви.
Одним из основных служений Церкви была евангелизационная работа на севере Карелии. Для этой цели было сформировано несколько выездных групп. Благодаря этому служению было открыто более 10 новых Церквей.
С 1995 года и по настоящее время пастором церкви является Игнатюк Олег Николаевич. Он был в составе миссионерской группы «Свет миру» которая летом 1989 года впервые приехала в Карелию, в г. Петрозаводск. Вместе с супругой Тамарой они воспитывают 5 детей — три сына и две дочери.
Строительство храма
В 1992 году началась подготовка собственного здания. Подбирался приемлемый проект. В феврале 1995 года главному архитектору города на рассмотрение были представлены два проекта. Выбор был сделан в пользу проекта финского архитектора Сакари Анттила, как наиболее уникального по красоте здания, которое органично вписывалось в ландшафт и в общую архитектуру города.
- 8 июля 1995 было совершено освящение места под строительную площадку.
- 2 сентября 1995 года приступили к рубке леса под строительную площадку.
- 25 июля 1999 года состоялось торжественное служение в новом здании Церкви по случаю завершения монтажных работ.
- 24 декабря 1999 года на купол храма был установлен крест.
- 23 октября 2004 года состоялось открытие и освящение храма.
Финансирование строительства осуществлялось за счёт пожертвований прихожан и благотворительности других церквей.
Подробнее о строительстве храма можно прочитать на сайте главы Республики Карелия.